Многорукий вирус: у индийского штамма оказалось еще больше мутаций

Новый вариант возбудителя COVID-19 быстрее распространяется и может частично ускользать от иммунитета

Многорукий вирус: у индийского штамма оказалось еще больше мутаций

Пик заболеваемости COVID-19 в Индии связывают с новыми вариантами коронавируса, среди которых штамм B.1.617, который стал ведущим во многих штатах. Этот штамм отличается от изначального уханьского десятками мутаций, а от близкого родственника — британского — как минимум восемью изменениями в гене шиповидного белка, утверждают российские эксперты. По предварительным данным исследований, индийский вариант вируса способен лучше проникать в клетки, а также может ускользать от иммунитета. Впрочем, описанный в научной литературе штамм B.1.617 и найденный в России вариант вируса — не одно и то же, утверждают в ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. В институте исследовали штаммы коронавируса от индийских студентов, приехавших на учебу в Ульяновск. Они прилетели девятью рейсами, прибывшими в период с 14 апреля по 10 мая, выяснили «Известия».

Ученые считают этот вариант вируса более опасным, но в РФ циркулируют и собственные модификации

Эволюционное преимущество

Индийскому штамму, обнаруженному в конце 2020 года, ВОЗ официально присвоила название «Дельта» (B.1.617.2). Считается, что этот штамм — виновник второй волны пандемии в Индии. Вариант «Дельта» также называют «двойным мутантом» из-за наличия изменений E484Q и L452R. Однако множество экспертов утверждают, что это название «вводит в заблуждение», так как мутации происходят в вирусе постоянно.

В научной литературе вирус «Дельта» считается более заразным и быстро распространяющимся. То есть, чтобы заболеть, понадобится меньшее количество вирусных частиц. Кроме того, есть научные работы, в которых сказано, что этот вариант легче уходит от вакцин и не реагирует на лечение плазмой переболевших. Также писали, что наиболее частые симптомы COVID-19, вызванного индийским вариантом, — головные боли, боль в горле и насморк.

Некоторые опрошенные «Известиями» эксперты связывают значительное повышение уровня заболеваемости в России с этим штаммом.

Данных по геномному секвенированию (прочтению геномов) штаммов коронавируса в России в открытых источниках крайне мало, отметил профессор Сколтеха, заведующий лабораторией молекулярной эволюции ИППИ РАН Георгий Базыкин, который весь последний год занимается анализом эволюции вируса и реконструирует его распространение по стране. В основном информацию размещает находящийся в Санкт-Петербурге российский консорциум по секвенированию геномов коронавирусов SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI). Он создан на базе Института гриппа имени А.А. Смородинцева.

— Если предположить, что во всей России происходит то же самое, что и в Санкт-Петербурге, то можно сказать, что этот вариант вируса распространяется крайне быстро. В последних образцах, полученных консорциумом, он преобладает в подавляющем количестве. Я думаю, что тот рост заболеваемости, который мы сейчас наблюдаем, отчасти связан с распространением этого варианта, а также варианта «Альфа» (так называемый британский. — «Известия»), — подчеркнул Георгий Базыкин.

По его словам, о процентном соотношении вариантов коронавируса в России говорить сложно, так как регионы представлены в базах данных неравномерно. Данные CoRGI говорят о том, что вариант «Дельта» занимал чуть больше половины (52%) во всех образцах, полученных в мае, и больше 90% — в тех, что были изучены в июне (22 из 24 полученных образцов). Такую скорость распространения варианту «Дельта» дает свойство повышенной трансмиссивности. Он распространяется быстрее уханьского варианта, а также варианта «Альфа», показывают данные из других стран.

— Это можно объяснить либо собственно биологическим преимуществом, когда этот вариант легче передается от человека к человеку. Либо же этот вариант эффективнее уходит от антител, из-за этого сильнее распространяется в частично переболевшей и вакцинированной популяции. Скорее всего, и тот и другой факторы имеют значение, — заключил Георгий Базыкин.

Рассказываем, действительно ли опасен индийский штамм коронавируса, какие симптомы могут наблюдаться при заражении и где уже обнаружен Delta+.

Статистика

По информации Российского консорциума по секвенированию геномов коронавирусов SARS-CoV-2, в мае в Санкт-Петербурге штамм «Дельта» находили в 52% образцов, в июне цифра увеличилась до 90%. Роспотребнадзор назвал этот вариант самым опасным в мире.

Чем опасен индийский штамм коронавируса? Одно из главных опасений международного медицинского сообщества — высокий темп распространения и инфицирования. Так, по данным на июнь признаки индийского штамма коронавируса «Дельта» выявлены в 85 государствах, «Дельта плюс» также активно распространяется, подтверждена госпитализация в восьми государствах (Индия, Панама, Кипр, Кыргызстан, Северная Македония, Малави, Кипр, Кюрасао).

Индия находится на втором месте по числу заболевших коронавирусной инфекцией SARS-CoV-2 с начала пандемии (более 30 млн). Рекордный прирост пришелся на первое полугодие 2021 года, в мае фиксировали примерно по 400 000 случаев заражения в день и свыше 4500 смертей. В Российской Федерации зафиксировано более 5 млн заболевших, количество летальных исходов — свыше 130 тысяч.

Пандемия коронавируса преподносит все новые сюрпризы. Справиться с распространением заболевания пока не удается. Да и болезнь оказывается куда более коварнее, чем считалось раньше. У инфекции появились новые симптомы и новый штамп.

Помогут ли вакцины против нового штамма?

Индийский штамп выработал сразу две мутации для обхода антител. Тем не менее, вакцины от этого не становятся неэффективными. Вакцинация – это создание искусственного иммунитета к болезни. При производстве вакцин их очищают от всего лишнего, оставляя лишь те вещества, что требуются для создания барьера от болезни. Чтобы сделать вакцину безопасной, возбудитель инфекции «убивают» или ослабляют до состояния минимальной активности: навредить он уже не в силах.

Разработчики и врачи утверждают, что на сегодняшний день вакцины защищают от индийского штампа. Если пациент получил оба компонента, это не значит, что он не заразится ковидом, но убережет себя от тяжелых последствий. Эффективность вакцины в отношении госпитализации составляет 98-99 %.

Для выработки коллективного иммунитета важно, чтобы было привито большинство людей. Иначе ничего не мешает новым штампам свободно распространяться. Из-за низких темпов вакцинации в России для некоторых категорий граждан ее стали делать обязательной.

Менять состав вакцин для адаптации к индийскому штампу коронавируса нецелесообразно. Бюрократические процедуры займут гораздо больше времени, чем создание самой вакцины. За этот период вирус снова мутирует, и появится очередной штамп. Имеющиеся вакцины остаются эффективными против тяжелых форм заболеваемости и смертности, только нужно получить обе дозы препарата.

ВОЗ призывает страны поделиться вакциной друг с другом, если ощущается ее нехватка. Прививка — это общая основа. Иммунная система после вакцинации узнает даже новый штамп и начинает бороться. Иммунная система сопротивляется инфекции и запоминает микроорганизм, который ее вызвал. При этом если микроб вновь попадает в организм, иммунная система эффективно борется: она уже знает как.

Вакцинированные, как правило, болеют в легкой или средней форме без осложнений. Их выписывают после пяти-семи дней наблюдений. Пациенты после столкновения с опасностью жалеют, что не привились вовремя. Главная причина тому, считают медики, — отсутствие информации о важности прививок. С людьми об этом практически не говорят. Результат — население читает непроверенные источники и делает ложные выводы.

Альтернативы вакцинации на сегодняшний день нет. Иммунизация населения должна продолжаться по плану.

Рассказываем, о каких штаммах коронавируса известно и чем они опасны.

Какие штаммы коронавируса есть и чем они отличаются?

Рассказываем, о каких штаммах коронавируса известно и чем они опасны.

– Слышала про какой-то новый опасный штамм коронавируса, из-за которого якобы человек может остаться без ног. Неужели это правда? Какие вообще есть штаммы коронавируса и следует ли их опасаться?

По данным опубликованным на GISAID (ресурс, который обеспечивает открытый доступ к геномным данным вирусов гриппа и коронавируса, ответственного за пандемию COVID-19 – прим. ред.), каждый вирус имеет свой геном – уникальную специфическую последовательность ДНК или РНК. Коронавирус SARS-CoV-2 относится к группе РНК-вирусов, довольно сложный геном которых зашифрован в длинной молекуле рибонуклеиновой кислоты (РНК).

Когда вирус воспроизводит копии самого себя, он иногда немного изменяется. Эти изменения называются «мутациями». Используя слово «штамм», учёные подразумевают генетически отличную ветвь вируса, отличающуюся одной или несколькими мутациями от своего «родителя».

По мере развития пандемии COVID-19, вызывающий заболевание коронавирус SARS-CoV-2 мутирует. Так, его штаммы могут представлять большую угрозу для человека, например, легче передаваться или вызывать более тяжёлое заболевание.

Основных штаммов нового коронавируса семь. В природе существует несколько тысяч штаммов вируса SARS-CoV-2. Их принято объединять в крупные группы – клады. В настоящее время известны следующие клады коронавируса: GR, G, GH, O, S, L и V . Ранее штаммы ассоциировали с географическим названиям. Однако чтобы не дискредитировать соответствующие страны, всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) приняла решение сменить классификацию на буквенную.

Началась пандемия со штамма L – именно его обнаружили в китайском Ухане в декабре 2019 года, в настоящее время классическая версия вируса постепенно исчезает.

Остальные штаммы распределены в странах мира с разной интенсивностью: на каждом континенте, как правило, существует не больше двух основных вариаций. Их распространение можно наблюдать на интерактивной карте Nextstrain, отслеживающей мутации вируса.

В настоящее время учёные выделяют 4 наиболее опасных штамма COVID-19.

Фото: Александр Плонский/ТАСС

Британский штамм – «Альфа»

Новую генетическую линию коронавируса SARS-CoV-2 – B.1.1.7 впервые зафиксировали осенью 2020 года в Великобритании. Она является одним из самых распространённых в странах Европы вариантов коронавируса, но не в России.

Этот штамм распространяется на 56-70% быстрее исходника. Некоторые учёные предполагают, что эта разновидность коронавируса приводит к смерти пациентов – на 30-70% чаще, чем классический штамм COVID-19. Однако в апреле 2021 года в журнале Lancet опубликовали исследование, специалисты которого не смогли подтвердить эту теорию. Также в учёные опровергли предположение об увеличении рисков повторно заразится этим штаммом, хотя и подтвердили, что альфа-вирус более заразен.

В Роспотребнадзоре заявили, что британский штамм коронавируса принципиально не отличается от «уханьского» или других штаммов, так как при мутации не произошло и 1% изменения в его геноме. И российские вакцины «Спутник V» и «ЭпиВакКорона» достаточно эффективны против этого штамма.

Доказано, что инфицированные британским штаммом редко теряют вкус и обоняние. В основном у заразившихся им распространены кашель, боль в горле, усталость, мышечные боли и лихорадка.

Фото: Министерство здравоохранения кировской области

Южноафриканский штамм – «Бета»

Новый вариант коронавируса SARS-CoV-2 501Y.V2/B.1.351, известный как «южноафриканский» штамм, впервые выявили в ЮАР в декабре 2020 года.

По информации Национального института инфекционных заболеваний в Йоханнесбурге, мутации нового варианта SARS-CoV-2 делают его устойчивым к антителам в плазме крови, донорами которой были пациенты, уже переболевшие коронавирусной инфекцией.

Бета-штамм активно распространяется среди молодых людей, так как способен лучше прикрепляться к клеткам организма. Болезнь при заражении именно этим штаммом протекает без каких-либо сопутствующих заболеваний и чаще приводит к серьёзным осложнениям.

В феврале 2021 года повышенную заразность штамма из ЮАР подтвердила Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ).

Бразильский штамм – «Гамма»

В январе 2021 года в Бразилии ученые сообщили о возникновении нового штамма коронавируса – B.1.1.248. Именно гамма-вариант стал причиной второй волны коронавируса в столице штата, городе Манаус. О его заразности говорит Что немало говорит о его заразности – около 70% жителей города ранее переболели оригинальным вариантом коронавируса и имело антитела, в том числе это связано и с антипрививочными взглядами президента страны Жаира Болсонару.

По данным экспертов, штамм является более заразным и опасным для молодых людей, а также снижает эффективность вакцин. При гамма-штамме болезнь имеет стандартные симптомы ковида, но сам вирус минимум гораздо заразнее исходного варианта. Также он умеет преодолевать естественный иммунитет уже переболевшего населения. Установлено, что бразильский вариант тяжелее протекает у молодёжи и беременных женщин.

В России гамма-вариант пока представлен единичными случаями. Как заявили 22 июля представители центра «Вектор», во всей стране выявили всего несколько случаев гамма-варианта. Зато, по данным американского Центра по контролю и профилактике заболеваний, этот вариант быстро распространился в США.

Индийский штамм – «Дельта»

Сегодня в мире доминирует именно дельта-штамм (B.1.617). В ВОЗ и Европейском центре по профилактике и контролю заболеваний считают, что он будет преобладать в мире и в ближайшие месяцы, так как его уже идентифицировали почти во всех европейских странах. Этот штамм впервые выявили в индийском городе Напур в октябре 2020 года.

Врачи считают, что этот штамм более заразен и способен избегать нейтрализации некоторыми моноклональными антителами (антитела, произошедшие из одной плазматической клетки-предшественницы – прим. ред.). Это значит, что антитела, появившиеся у переболевшего COVID-19 человека, могут быть не эффективны в борьбе со штаммом дельта.

Руководитель Екатеринбургского НИИ вирусных инфекций «Вектор» Роспотребнадзора Александр Семенов считает, что вирус дельта, сменив классический уханьский штамм, по течению болезни стал более гриппоподобным. Больные индийским штаммом чаще жалуются на головную боль, боль в горле, повышенную температуру, кашель и насморк, для них совсем не характерна потеря обоняния. Молодые и здоровые люди легко могут принять заражение дельта-штаммом за простуду. Но вместе с тем пациенту может стать хуже буквально за два-три-четыре дня.

Для течения средней тяжести болезни дельта вирусом характерны следующие характеристики: сильные боли в суставах, сильные боли в животе, тошнота, рвота, высокая температура, лихорадка, потеря слуха, спутанность сознания, гангрена. Это связано с тем, что при бразильском штамме у пациентов увеличивается риск возникновения тромбов в кровеносных сосудах кишечника, рук и ног.

Менее угрожающие штаммы

Буквы «эта», «йота», «каппа» и «лямбда» ВОЗ определили как менее угрожающие в эпидемиологическом плане штаммы. представляющим научный интерес:

«эта» – нигерийский штамм (B.1.525);

«йота» – американский штамм (B.1.526);

«каппа» – индийский штамм (B.1.617);

«лямбда» – перуанский штамм (C.37).

Однако лямбда-вирус вызывает у мирового научного сообщества всё больше беспокойства. До сих пор Лямбда была распространена только в странах Латинской Америки: Чили, Перу, Аргентину и Эквадор. На днях первых инфицированных такой мутацией коронавируса выявили в Великобритании.

Линия Лямбда имеет 8 ключевых мутаций. Молекулярный биолог Константин Семёнов в интервью для издания «Московский комсомолец» предположил, что именно из-за этого вирус устойчив к антителам, полученным человеком после вакцинации или после естественной инфекции.

По мнению молекулярного биолога и биотехнолога индийского Университета Мадраса доктора Прийома Бозе, лямбда-вирус ещё и передаётся от человека к человеку гораздо быстрее.

Однако учёные считают, что повышенная вирусная инфекционность не всегда является свидетельство того, что вирус будет быстро и масштабно распространяться. Например, вариант Эпсилон ВОЗ признали не представляющим опасности. Так как на фоне своей высокой способности к заражению он не смог распространиться в человеческой популяции.

Фото: Министерство здравоохранения Кировской области

Сколько штаммов коронавируса в России?

О том, сколько штаммов коронавируса есть в России, точно неизвестно. Из известных штаммов в РФ были выявлены британский, южноафриканский, индийский и несколько локальных.

По словам Руководителя научной группы разработки новых методов диагностики заболеваний человека Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии Роспотребнадзора Камиля Хафизова, нельзя точно сказать, что у человека есть иммунитет к определённому штамму коронавируса. Именно поэтому возможно, что вакцины против COVID-19 придётся периодически обновлять и иммунизироваться ежегодно, как это сейчас происходит с тем же вирусом гриппа.

– Думаю, к осени мы накопим достаточное количество данных по эффективности существующих вакцин против новых штаммов. Потому еще раз говорю: на данный момент известных причин избегать вакцинации нет, если только нет прямых противопоказаний по состоянию здоровья, – отметил Камиль Хафизов.

1. Основных штаммов нового коронавируса семь. Ранее штаммы ассоциировали с географическим названиям. Чтобы не дискредитировать соответствующие страны, ВОЗ приняли решение сменить классификацию на буквенную: GR, G, GH, O, S, L и V. Началась пандемия со штамма L – именно его обнаружили в китайском Ухане в декабре 2019 года. В настоящее время учёные выделяют 4 наиболее опасных штамма COVID-19.

2. Штамм «Альфа» – один из самых распространённых в странах Европы вариантов коронавируса, но не в России. Штамм распространяется на 56-70% быстрее исходника. Инфицированные британским штаммом редко теряют вкус и обоняние. В основном у заразившихся им распространены кашель, боль в горле, усталость, мышечные боли и лихорадка.

3. Штамм «Бета» устойчив к антителам в плазме крови, донорами которой были пациенты, уже переболевшие коронавирусной инфекцией. Бета-штамм активно распространяется среди молодых людей. В ВОЗ подтвердили его повышенную заразность.

4. Штамм «Гамма», по данным экспертов, является более заразным и опасным для молодых людей, а также снижает эффективность вакцин. При гамма-штамме болезнь имеет стандартные симптомы ковида. Также он умеет преодолевать естественный иммунитет уже переболевшего населения. В России гамма-вариант пока представлен единичными случаями.

5. Больные индийским штаммом «Дельта» чаще жалуются на головную боль, боль в горле, повышенную температуру, кашель и насморк, для них совсем не характерна потеря обоняния. При тяжёлом протекании болезни у пациента могут появится сильные боли в суставах, тошнота, рвота, потеря слуха, гангрена. Это связано с тем, что при бразильском штамме у пациентов увеличивается риск возникновения тромбов в кровеносных сосудах кишечника, рук и ног. Антитела, появившиеся у переболевшего COVID-19 человека, могут быть неэффективными в борьбе с этим штаммом.

6. Менее угрожающими штаммами ВОЗ считают: «эта» – нигерийский штамм; «йота» – американский штамм; «каппа» – индийский штамм; «лямбда» – перуанский штамм. Однако лямбда-вирус вызывает у мирового научного сообщества достаточно беспокойства. Ранее Лямбда была распространена только в странах Латинской Америки, но на днях первых инфицированных такой мутацией коронавируса выявили в Великобритании.

7. О том, сколько штаммов коронавируса есть в России, точно неизвестно. Из известных штаммов в РФ были выявлены британский, южноафриканский, индийский и несколько локальных.

Если у вас есть вопросы, на которые вы не можете найти ответ, задайте их нам, и мы постараемся на них ответить.

Штаммы, вызывающие наибольшую обеспокоенность у ВОЗ: «британский», «южноафриканский», «бразильский», «индийский». Симптоматика, распространённость, лечение.

Дельта-штамм коронавируса

Клиническая картина

В Индии, где не утихает эпидемия Сovid-19, ученые выявили новый штамм коронавируса, более заразный и разрушительный по сравнению с классическим, «бета» и «гамма» штаммами. Его главная опасность в резистентности сразу к двум прививкам: британской AstraZeneca и индийской Bharat Biotech. Как пишет медицинский журнал The Lancet, есть риск, что немецкая вакцина Pfizer тоже окажется бесполезной.

Среди характерных отличительных признаков течения средней тяжести дельта-штамма выделяют следующие:

• сильные боли в суставах,
• сильные боли в животе,
• тошнота,
• рвота,
• высокая температура
• лихорадка,
• потеря слуха,
• спутанность сознания,
• гангрена.

Больные «дельта» в легкой форме жалуются на головную боль, боль в горле, повышенную температуру, кашель и насморк. Молодые и здоровые люди могут легко принять заражение дельта-штаммом за простуду.

Для этого штамма нехарактерна потеря обоняния, зато характерна потеря слуха и даже конечностей! Дело в том, что у больных увеличивается риск возникновения тромбов в кровеносных сосудах кишечника, рук и ног, а некоторым пациентам потребовалась ампутация пальцев или рук. Способность дельта-штамма провоцировать гангрену вызвала панику у местного населения.

Распространенность

Любопытен тот факт, что официальная позиция индийских СМИ относительно источника распространения новой инфекции отличается от общепризнанной: индусы считают первоисточником Великобританию.

Темпы распространения дельта-коронавируса очень высокие: например, если в 2020 году Нью-Дели зафиксировали 10,3 млн случаев инфицирования коронавирусом, то за первое полугодие этого число пострадавших перевалило уже за 18,6 млн. Похоже, вместо открытия границ стоит ждать повторения прошлогодних локдаунов по мере распространения новой мутации вируса, а он уже проник в Россию и еще 64 страны. По данным открытого российского консорциума по секвенированию геномов SARS-CoV-2 в мае 2021 г. дельта-штамм составлял 52% из всех полученных российских образцов, а в середине июня — уже более 90%. 17 июня 2021 г. глава Роспотребнадзора Анна Попова назвала дельта-штамм самым распространенным штаммом SARS-CoV-2 в мире. ВОЗ рекомендовало странам ограничивать авиасообщения.

Лечение

На данный момент терапия пациентов с дельта-штаммом коронавируса не отличается от лечения заразившихся «классическим» коронавирусом, но схемы лечения будут корректироваться, сообщил министр здравоохранения Михаил Мурашко.

Все существующие препараты от коронавируса являются менее эффективными перед его дельта-штаммом, однако они показали неплохие результаты при лечении тяжелого состояния пациентов.

15 июня 2021 г. в твиттере «Спутника V» говорилось со ссылкой на исследование Центра Гамалеи, что препарат более эффективен против дельта-штамма, чем любая другая вакцина.